تدور احداث الفيلم حول المبرمج المعروف باسم (نيو) كقرصان حواسيب، ينضم إلى مجموعة محاربين ضد الآلات بعد دخوله عالم ماتريكس وتحريره بتناول حبة حمراء، يدرك أنه في عام 2199 ويشتعل الصراع بين البشر والآلات